тебе надо будет сохранить сохранить следующие файлы:
boot.ini
bootsect.dos
ntdetect.com
NTLDR
ntbootdd.sys (если у тебя хард скази)
они находятся на диске Си.
а еще лучше, сделать repair disk для w2k (соответственно из w2k)

но это еще не все. так как при установке windows 98 он затирает mbr, то даже после восстановления этих файлов w2k бутменеджер подниматься не будет.
у тебя есть два выхода:
либо установить windows 98, предварительно сообщив ему, чтобы не трогал mbr:

Для этого в файле MSBATCH.INF (если такого файла в вашем дистрибутиве нет, создайте его) нужно прописать следующие строки: [Setup] CleanBoot=0 После установки Win9x устанавливает загpyзкy по умолчанию на себя, но это легко меняется. Если дистрибутив Win9x находится на CD (как это обычно и бывает), то исправленный или новосозданный MSBATCH.INF можно использовать, запустив программу установки Win9x с параметром: setup.exe диск:\путь\MSBATCH.INF В данном случае файл можно назвать как угодно, а не только MSBATCH.INF.

либо после установки запустить предварительно созданную загрузочную дискетку windows 98 и набрать комманду:
fdisk /mbr

но первый способ надежнее.

надеюсь это будет не слишком трудно